一、 行政院核定之「新興傳染病暨流感大流行應變整備及邊境檢疫計畫」主要執行工作項目，包括港埠檢疫作業、強化監測網絡、韌性國內醫療防疫應變體系、物資 整備等，執行期程111年至116年，所需總經費約40餘億，其中111年至113年經立法院核定預算數分別為248,061千元、264,887千元及265,146千元，111年及112年預算執行率100%，113年截至6月30日預算執行率亦幾達原定進度，113年預算已執行5成，並無落後情形。
二、 有關委員稱該計畫執行達成率僅13.65%，資料係擷取自公共政策平臺，13.65%係指111年至113年立院核定預算數(778,094千元)占計畫111年至116年總經費(40餘億)之比例，重申本計畫至113年第2季預算執行率幾完成。
因應近期COVID-19、流感等疫情升溫，疾管署未曾懈怠，持續推動四大應變策略，疫情、物資、醫療、衛教等層面防疫工作均無中斷，力求穩定疫情，降低COVID-19、流感等疾病衝擊。各項策略執行說明如下：
一、密切疫情監測：持續監測及掌握國內外疫情趨勢、流行變異株、病例嚴重度等變化，於每週例行記者會對外說明，另視疫情狀況及防治措施調整不定期發布新聞稿主動與民眾溝通。
二、強化防疫物品儲備與調度：
(一) 隨時確保防疫物資數量充足，全國儲備外科手術口罩、N95口罩、防護衣及隔離衣均高於安全儲備量。
(二) 釋出300萬劑家用快篩試劑至基層醫療院所，由專業人員評估提供給有醫療實際需要者使用。醫療院所名單可至疾管署官網/新冠流感最新防疫資訊專區/疾管署COVID-19家用快篩試劑之合作醫療院所名單( https://gov.tw/q3W )查詢。
(三) 積極儲備足量COVID-19抗病毒藥物並提升可近性，並持續推動新冠疫苗接種計畫提升國人免疫力。目前新冠抗病毒藥物倍拉維(Paxlovid)、瑞德西韋(Remdesivir)及疫苗皆充裕，增加採購之2萬人份莫拉皮拉維(Molnupiravir)已於7月4日起陸續配送，亦依適用狀況主動協助跨縣市/區域調度抗病毒藥物。
(四) 再次擴大公費流感抗病毒藥劑用藥措施，自6月26日起至7月31日，公費流感抗病毒藥劑使用條件增列「有類流感症狀，且家人/同事/同班同學有類流感發病者」1項，籲請醫師依病患狀況及臨床專業決定用藥治療之時機及必要性。
三、研訂相關臨床及感染管制指引供醫療照護機構參考運用：持續掌握並參考世界衛生組織(WHO)、美國疾病控制及預防中心(US CDC)及國家衛生研究院(NIH)等專業單位公布之最新指引，以及國際最新實證文獻，適時修訂相關指引。
四、加強衛教及醫療院所合作：
(一) 透過多元管道衛教提升民眾防疫知能，強化風險溝通與防疫衛教。
(二) 請醫療院所針對具重症風險因子快篩陽性民眾及早開立抗病毒藥物。