疾管署指出，新增檢出56例Omicron變異株確定病例，其中41例本土個案均為XBB (重點變異株30例EG.5、3例XBB.1.16、3例XBB.1.9.1、1例XBB.1.5)；另15例境外移入個案分別為14例XBB (重點變異株6例EG.5、2例XBB.1.16、2例XBB.1.9.1、1例XBB.2.3)及1例BA.2.86。上週新檢出1例境外移入Omicron BA.2.86個案，該個案於9/28自土耳其入境；本土病例尚無檢出BA.2.86變異株。近四週監測總計，本土檢出病毒株XBB (97%)為主流株，重點變異株以EG.5 (57%)為多，其次為XBB.1.16 (9%)及XBB.1.9.1 (6%)。國際變異株監測部分，截至今(2023)年10月15日，依全球共享流感數據倡議組織(GISAID)資料顯示，全球XBB及其衍生變異株占比約98.1%，其中EG.5占比持續上升(47.8%)，另需留意變異株XBB.1.16(16.4%)及XBB.1.5(9.7%)占比則持續下降，監測中變異XBB.1.9.1(9.0%)、XBB(3.6%)及XBB.1.9.2(2.9%)占比亦下降，而XBB.2.3(8.7%)則持平。
疾管署進一步說明，有關國內首次檢出之BA.2.86變異株，為Omicron BA.2子代變異株，該變異株於棘蛋白(spike protein)基因中相較於BA.2有34個突變，與XBB.1.5相較有超過35個突變，相較於武漢原始株有58個突變。該變異株於今年7月24日首次於丹麥發現，截至10月16日上午9點，依全球共享流感數據倡議組織(GISAID)資料顯示，已有30國上傳654組序列，包含英國、美國、瑞典、丹麥、法國、西班牙及加拿大等。依據WHO評估，BA2.86變異株於棘蛋白基因上出現大量突變，因潛在風險未知，需更多的監測數據來評估可能的風險，因此於8月17日列為監測中變異株(variant under monitoring，VUM)。疾管署也將持續監測該變異株病毒特性及流行情形。
疾管署強調，國內近期COVID-19疫情呈緩升趨勢，併發症中65歲以上長者占78%，鑒於國內外疫情仍持續且以XBB為主流病毒株，為降低長者感染COVID-19後發生重症和死亡風險，提升國民對抗主流病毒株之免疫保護力，請滿6個月以上民眾儘速前往接種XBB.1.5疫苗，儘早獲得保護力，減少病毒對健康的威脅。
疾管署再次呼籲，XBB.1.5疫苗對於目前正流行的變異株，包括XBB.1.5、XBB.1.16、XBB.2.3.2，以及EG.5.1等皆具免疫保護力，請民眾踴躍接種，減少感染及重症風險。另亦提醒持續落實手部衛生及咳嗽禮節等衛生好習慣，年長者或免疫低下者外出時，或於人潮聚集且無法保持適當距離或通風不良之場所、與年長者或免疫低下者密切接觸時，建議要戴口罩維護自身健康。如出現發燒或咳嗽、流鼻涕、喉嚨痛等疑似症狀，請儘速就醫並在家休息，避免接觸脆弱族群，保護自己與他人。